De Spaanse Waterhond kan in meerdere vachtkleuren voorkomen, onder andere bruin, zwart, beige en bi-colors.
Een bruine vachtkleur kan voorkomen in verschillende tinten en met witte aftekeningen op het lichaam zijn toegestaan, evenals volledig bruin zonder witte aftekeningen.
De vacht kan volledig zwart zijn, maar witte aftekeningen zijn toegestaan. De vacht kan bij sommige honden lichter worden, waardoor deze 'grijzer' wordt.
Een bicolor is een vacht die bestaat uit 2 kleuren, bijvoorbeeld wit-bruin of wit-zwart. Er komen verschillende soorten bonte aftekeningen voor.
Beige is een verbleking van de kleuren bruin óf zwart, wat is te zien aan de kleur van de neus van de hond. Er bestaan beige honden met een zwarte neus en beige honden met een bruine neus.
De beige (crème) vacht kan witte aftekeningen bevatten.